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Next Generation Sequencing (NGS)

Nel gennaio 2017 è stata installata la nuova strumentazione NextSeq500  per il sequenziamento massivo parallelo Next Generation Sequencing (NGS), una tecnologia innovativa e altamente versatile, che permette il sequenziamento di DNA e RNA ad elevate prestazioni.

 

Illumina NextSeq500 ha una produttività massima di 120 Gb e permette di sequenziare contemporaneamente fino a 800 milioni di sequenze di acidi nucleici per ciascuna run, impiegando un tempo medio di 24ore.

 

Il CIRC dispone inoltre dal 2012 di una piattaforma Illumina HiScanSQ.

il Centro è dotato di un server per l'analisi dei dati. Il parco hardware consiste di una memoria di storage di 60TB, 128 GB di RAM e 48 core.

Indicazioni tecniche

Le applicazioni

  • Whole-Exome Sequencing
  • Whole-Transcriptome Sequencing
  • Gene Expression Profiling
  • Small Genome Sequencing (bacteria, virus)
  • ChIP sequencing
  • Methylation Sequencing
  • miRNA & Small RNA Analysis
  • Targeted Gene Sequencing (amplicon/enrichment)
  • Whole-Genome Sequencing (human,plant,animal

Personale Specializzato

Accesso

Per usufruire della piattaforma Illumina NextSeq500 è necessario contattare il Centro Interdipartimentale di ricerche sul cancro "Giorgio Prodi"- CIRC via mail circ@unibo.it

Per informazioni tecniche, contattare la Dott.ssa Annalisa Astolfi: Tel: +39 051 2144464 o +39 051 2144663.  mail: annalisa.astolfi@unibo.it

 

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