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Tecnologie

Il Centro interdipartimentale di ricerche sul cancro “Giorgio Prodi” - CIRC dell'Università degli Studi di Bologna ha investito fortemente negli ultimi anni nel campo dell’analisi genomica dei tumori, acquisendo due strumentazioni di elevato contenuto tecnologico per lo studio del genoma del cancro: Affymetrix e Illumina HiScanSQ

Il CIRC è l’unica struttura di Bologna a disporre di queste tecnologie avanzate e del personale e delle competenze per interpretarne i risultati.

Affymetrix

Panoramica
Una piattaforma per analisi whole genome di gene expression, copy number, studi di associazione di SNP e CNV, farmacogenomica (DMET) e tiling (ChIP e methylation).
Gene expression
Studio del profilo di espressione genica nei tumori
SNP-array
Chip di genotyping per analisi citogenetica ad alta risoluzione e studi di associazione
DMET
Array di farmacogenetica e drug metabolism, per identificare le varianti genetiche associate alla risposta ai farmaci
AFFYMETRIX: risultati ottenuti

Next Generation Sequencing (NGS)

Panoramica
Una piattaforma per il sequenziamento massivo genomico e trascrittomico
HiScanSQ
Sistema di sequenziamento
cBot
Sistema per la generazione di cluster
Server
Risorse computazionali per l'analisi dei dati
Produttività
Quanti dati è possibile ottenere e il quali tempi?
Detection di Riarrangiamenti Cromosomici
ILLUMINA HiScanSQ: risultati ottenuti

In evidenza

Accesso a Affymetrix e Illumina HiScanSQ
Modalità di accesso alle piattaforme

Contatti

Annalisa Astolfi

Cat. D - area tecnica, tecnico - scientifica ed elaborazione dati

Centro Interdipartimentale di Ricerche sul Cancro "G. Prodi" (CIRC)

Via Massarenti 9

Bologna (BO)

tel: +39 051 636 4 464

Informazioni aggiuntive
Per informazioni tecniche sulle piattaforme Affymetrix e Illumina HiScanSQ