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Affymetrix

Nell’Aprile del 2006, grazie al finanziamento della Fondazione Cassa di Risparmio di Bologna, il Centro ha acquisito la strumentazione Affymetrix, che consente di analizzare l’espressione genica, di caratterizzare i polimorfismi del DNA ed effettuare analisi citogenetiche ad altissima risoluzione.

Attualmente la strumentazione consente di quantificare su un solo chip più di 30,000 trascritti codificanti e più di 11,000 long non-coding RNA, o di rilevare fino a 5.32 milioni di marcatori sul DNA per analisi di copy number e di genotyping, e di genotipizzare 1,936 SNP e varianti complesse su 231 geni di interesse farmacogenetico.

Introduzione

Applicazioni

  • Gene expression - Studio del profilo di espressione genica nei tumori
  • SNP-array - Chip di genotyping per analisi citogenetica ad alta risoluzione e studi di associazione
  • DMET - Array di farmacogenetica e drug metabolism, per identificare le varianti genetiche associate alla risposta ai farmaci.

I risultati ottenuti

Accesso

Per usufruire della piattaforma Affymetrix per analisi di gene expression, SNP-array (associazione o citogenetica), o farmacogenomica (DMET), è necessario contattare il Centro Interdipartimentale di ricerche sul cancro "Giorgio Prodi"- CIRC compilando l'apposito modulo.

Il modulo compilato e firmato deve essere inviato al Direttore del Centro e alla Segreteria Amministrativa via mail circ@unibo.it o via fax allo +39 051 349655.

Per informazioni tecniche, contattare la Dott.ssa Annalisa Astolfi: Tel: +39 051 6364464. mail: annalisa.astolfi@unibo.it