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Affymetrix

Nell’Aprile del 2006, grazie al finanziamento della Fondazione Cassa di Risparmio di Bologna, il Centro ha acquisito la strumentazione Affymetrix, che consente di analizzare l’espressione genica, di caratterizzare i polimorfismi del DNA ed effettuare analisi citogenetiche ad altissima risoluzione.

Attualmente la strumentazione consente di quantificare su un solo chip più di 540,000 trascritti codificanti e non-coding e di identificare le varianti di splicing, o di rilevare fino a 2.67 milioni di marcatori sul DNA per analisi di citogenetiche incluso mosaicismi e UPD, e di genotipizzare 1,936 SNP e varianti complesse su 231 geni di interesse farmacogenetico.

Applicazioni

  • Gene expression - Studio del profilo di espressione genica nei tumori
  • SNP-array - Chip di genotyping per analisi citogenetica ad alta risoluzione e studi di associazione
  • DMET - Array di farmacogenetica e drug metabolism, per identificare le varianti genetiche associate alla risposta ai farmaci.

Accesso

Per usufruire della piattaforma Affymetrix è necessario contattare il Centro Interdipartimentale di ricerche sul cancro "Giorgio Prodi"- CIRC via mail circ@unibo.it

Per informazioni tecniche, contattare la Dott.ssa Annalisa Astolfi: Tel: +39 051 2144464 o +39 051 2144663.  mail: annalisa.astolfi@unibo.it